Las organizaciones del movimiento indígena del Ecuador tienen una estructura “piramidal”, cuya base son las organizaciones locales de primer grado o de base (que pueden integrarse por comunidades, cooperativas, asociaciones, centros u otras organizaciones de pequeños grupos). Las organizaciones de primer grado están agrupadas a nivel provincial en organizaciones de segundo grado estos, a su vez, están organizadas en federaciones a nivel regional o de tercer grado.